Aide e-FLORA-sys Dernière mise à jour : 6 novembre 2009

Glossaire

Contenu

Vous débutez avec e-FLORA-sys ?

Connexion en utilisateur identifié
Relevés floristiques
Espèces
Stations
Associations végétales   
Sols
Climats
Pratiques agricoles
Etudes
 
FAQ - Questions courantes


Vous débutez avec e-FLORA-sys ?

1. Quelques mots sur les objectifs d'e-FLORA-sys

e-FLORA-sys est un système informatique web gratuit qui permet la gestion d'informations sur les prairies (végétation, sol, climat, pratiques agricoles), et l'interprétation agronomique et écologique des relevés floristiques. Il offre une base de connaissances sur près de 3000 espèces prairiales de l'Europe de l'Ouest. Le système a pour vocation d'aider les techiciens et les scientifiques concernés par la flore des prairies permanentes, soit dans un but de gestion de ces prairies, soit pour conduire des travaux de recherche sur l'agronomie et l'écologie des prairies permanentes. e-FLORA-sys a clairement un objectif à l'interface de l'agronomie et de l'écologie (ex : calcul de la valeur fourragère et écologique d'une prairie), et ne constitue pas un site de botanique. A cette fin, de nombreux liens vers des sites sur la botanique sont fournis. 

Les auteurs d'e-FLORA-sys souhaitent également en faire une base nationale de référence sur les prairies permanentes et les couverts herbacés à usage agricole. Dans cet objectif, nous avons souhaité qu'e-FLORA-sys soit gratuit, facilement accessible (accè par internet), mais qu'il préserve également la propriété des informations saisies des utilisateurs.

e-FLORA-sys est une création du laboratoire Agronomie et Environnement, unité mixte de recherche entre Nancy-Université et l'INRA, localisé à Nancy et à Colmar. Le développement informatique est assuré par le Centre de Ressources Informatiques de l'INPL. Lancé en septembre 2009, e-FLORA-sys succède au logiciel monoposte FLORA-sys créé en 1992.
 

2. Comment fonctionne e-FLORA-sys

e-FLORA-sys fonctionne selon deux modes :
    - un mode "visiteur" qui permet d'accéder à la base de données complète sur les caractéristiques des espèces, et à un jeu de 10 relevés pour découvrir les fonctionnalités du système,
    - un mode "utilisateur identifié" qui permet de saisir ses propres relevés, et accéder à toutes les fonctionnalités d'e-FLORA-sys. Pour savoir comment s'identifier, cliquer ici

AVERTISSEMENT : Certaines fonctionnalités d'e-FLORA-sys ne sont pas encore activées ... leur développement est prévu au cours de l'année 2010. N'hésitez pas à consulter régulièrement le site pour découvrir les mises à jour. Merci de votre patience !

3. Vos premiers pas avec e-FLORA-sys

Pour un utilisateur non identifié, il suffit de cliquer sur les items du menu vertical situé à gauche de la page d'accueil de e-FLORA-sys. En cliquant sur chaque item (Espèces, Relevés floristiques, Stations, ...), on voit apparaitre le début de la base de données concernée. Pour rechercher un élément (une espèce, un relevé,  une station, ...), saisir son nom dans la boite en haut et à droite de la liste, puis cliquer sur "Search". Se placer sur l'élément souhaité de la base de données (une espèce, un relevé,  une station, ...) et cliquer sur "Voir". La fiche correspondant à l'élément apparait, et le détail des informations est accessible en cliquant sur les boites rassemblant les informations par catégorie. L'utilisateur non identifié peut seulement consulter des informations et exporter les informations relatives aux 10 relevés floristiques données en exemple, mais ne peut pas modifier le contenu des bases de données d'e-FLORA-sys.

Un utilisateur identifié peut accéder à l'ensemble des fonctionnalités d'e-FLORA-sys. Il reste propriétaire des données qu'il saisit, et qui ne sont visibles que de lui-même et de l'administrateur du site. Un utilisateur identifié peut demander à l'administrateur du site d'autoriser une ou plusieurs personnes à consulter et /ou modifier les données qu'il a saisies.

Les principales actions qu'un utilisateur peut faire dans e-FLORA-sys sont les suivantes

Demander à être un utilisateur identifié : cliquer ici

Enregistrer un nouveau relevé floristique
Cette opération peut se faire soit par la saisie directe des informations, soit par l'importation des données à partir d'un fichier. Ces opérations sont décrites dans la rubrique "Relevés floristiques". Cette même rubrique explique comment modifier voire supprimer un ou des relevés floristiques existant.
Avant de saisir un nouveau relevé, il est  important de vérifier si les informations sur la station où le relevé a été réalisé ont bien été saisies. le cas échéant il fau créer une nouvelle station. La méthode de  création d'une nouvelle station est décrite dans la rubrique "Stations"
La saisie d'une station est obligatoire pour enregistrer un nouveau relevé. Il est par contre facultatif (mais conseillé pour la richesse de la base de données) de saisir les informations sur les pratiques agricoles, le sol et le climat.

Consulter et exporter un relevé floristique existant et les informations pour le diagnostic agronomique et écologique
Un utilisateur identifié peut consulter les relevés qu'il a enregistré, ou les relevés qu'il a le droit de consulter (droit accordé par l'auteur principal du relevé). Les informations consultables concernent le relevé lui même, mais également les informations sur la station, les pratiques agricoles, le sol et le climat, ainsi que les indices calculés pour évaluer la valeur écologique et agronomique de la prairie. e-FLORA-sys permettra en outre, à partir de 2010, de calculer la proximité entre un relevé et une association ou un type de relevé (ex : issu d'une typologie).
Toutes ces informations seront (1er trimestre 2010) exportables sous différents formats informatiques (pdf, texte ou csv pour Microsoft Excel). Ces opérations sont décrites dans la rubrique "Relevés floristiques".

Consulter la base des espèces prairiales
La base des espèces d'e-FLORA-sys est entièrement accessible à tous (utilisateurs identifiés ou non identifiés), mais les informations ne peuvent être modifiés que par l'administrateur du site. Les informations contenues dans la base sont issues de différentes sources françaises et internationales. Ces sources sont disponibles pour chaque type d'information en consultant le glossaire.
Si vous souhaitez la saisie d'une nouvelle espèce, ou d'informations sur une espèce existante, prendre contact avec l'administrateur du site en cliquant ici. 
Le détail  des opérations de consultation de la base des espèces est décrit dans la rubrique "Espèces".

Retour au sommaire de l'aide

Connexion en utilisateur identifié

Etre déclaré comme utilisateur identifié est indispensable pour pouvoir saisir un nouveau relevé. La demande doit être faite à l'administrateur du site, en cliquant ici, et en précisant ses nom, prénom, adresse (postale et électronique), et le cas échéant l'organisme employeur. Les conditions de confidentialité des informations fournies sont précisées ici. En réponse à cette demande, l'administrateur du site renverra un login et un mot de passe personnel.

Pour se connecter, il faut saisir le nom d'utilisateur et le mot de passe comme indiqué ci-dessous

accueil_loginpwd

Après avoir validé, un item supplémentaire "My account" apparaît dans le menu principal, à gauche de l'écran d'accueil . Cliquersur "My account" (flèche sur la copie d'écran ci-dessous) pour faire apparaitre les données du compte (entourées en jaune sur  la copie d'écran ci-dessous)

accueil_myaccount

Les informations relatives au compte sont les suivantes : nom et prénom du titullaire du compte, droits d'utilisation, langue par défaut pour l'édition et la saisie des espèces.

Retour au sommaire de l'aide

Relevés floristiques

Texte d'aide en cours de rédaction ... merci de votre patience

Saisir un nouveau relevé

Retour au sommaire de l'aide

Espèces

Texte d'aide en cours de rédaction ... merci de votre patience
Retour au sommaire de l'aide

Stations

Texte d'aide en cours de rédaction ... merci de votre patience
Retour au sommaire de l'aide

Associations végétales   

Texte d'aide en cours de rédaction ... merci de votre patience
Retour au sommaire de l'aide

Sols

Texte d'aide en cours de rédaction ... merci de votre patience
Retour au sommaire de l'aide

Climats

Texte d'aide en cours de rédaction ... merci de votre patience
Retour au sommaire de l'aide

Pratiques agricoles

Texte d'aide en cours de rédaction ... merci de votre patience
Retour au sommaire de l'aide

Etudes

Texte d'aide en cours de rédaction ... merci de votre patience
Retour au sommaire de l'aide

FAQ - Questions courantes


Texte d'aide en cours de rédaction ... merci de votre patience
Retour au sommaire de l'aide



------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

Administrateur du site

e-FLORA-sys est un site hébergé sur le serveur du Centre de Ressources Informatiques (CRI) de l'Institut National Polytechnique de Lorraine (INPL) à Nancy. L'administrateur actuel du site est Sylvain PLANTUREUX, Professeur d'Agronomie à l'INPL-ENSAIA, et au laboratoire Agronomie et Environnement Nancy-Colmar, Unité Mixte de Recherches (UMR 1121) entre Nancy Université et l'INRA.

L'administrateur du site est le responsable du site. A ce titre, il a accès, avec les personnels informaticiens du CRI, à l'ensemble des informations stockées dans les bases de données d'e-FLORA-sys, et notamment aux relevés floristiques saisies par les utilisateurs identifiés. L'administrateur du site s'engage notamment à assurer la stricte confidentialité des informations renseignées par les utilisateurs. A ce titre, il s'interdit toute divulgation ou utilisation des données saisies par les utilisateurs, et veille au respect de cette interdiction par les informaticiens qui développent le site. Toute utilisation même partielle de ces données devra faire l'objet d'une autorisation expresse des utilisateurs. 

La sécurité des informations est assurée par des sauvegardes quotidiennes réalisées par le CRI de l'INPL

Retour au sommaire de l'aide
------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

Glossaire


A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z

A

Abondance-Dominance

L'abondance d'une espèce se définit par un nombre d'individus d'une même espèce. Rapportée à une unité de surface, cette grandeur exprime alors une densité.
La dominance ou recouvrement expriment l'occupation des organes aériens en projection verticale sur le sol. On distingue le recouvrement absolu (en pourcentage de la surface du sol) et le recouvrement relatif (par rapport au total des recouvrements de toutes les espèces). Le recouvrement absolu de chaque espèce d'un relevé floristique peut varier de 0 à 10%%, tandis que la somme des recouvrements relatifs des espèces d'un relevé floristique est égale à 100%
Source : F.GILLET (2000). Méthodes d'étude de la végétation. 70p. Ed Université de Neufchâtel
Des coefficients associant abondance et dominance sont utilisés dans la méthode de Braun-Blanquet

Retour index

Abréviation

Abréviation du nom de l'espèce constituée de 7 lettres, généralement les 3 premières lettres du nom de genre, et les 4 premières lettres du nom d'espèce. Exemple : Arrelat est l'abréviation d'Arrhenatherum elatius. Cette règle générale comporte des exceptions, afin déviter les doublons, et d'assurer qu'une abréviation ne corresponde qu'à une seule espèce. Lors de la saisie d'une nouvelle espèce, e-FLORA-sys définit automatiquement une abréviation selon la règle générale, et propose le cas échéant (abéviation existante) de saisir cette abréviation.  

Retour index

Association (végétale)

Voir définition fournie par le site Telabotanica : cliquer ici
Pour e-Flora-sys, la notion d'association végétale peut recouvrir à la fois un groupement végétal défini au sens phytosociologique du terme, mais également  la description d'un groupement végétal représentatif d'une typologie (référence à des typologies régionales). e-FLORA-sys offre la possibilité de calculer la proximité entre un relevé floristique et une ou plusieurs associations végétales

Retour index

Azote (Indice de fertilité)

Indice de fertilité azotée du sol selon Ellenberg.
L'indice spécifique varie de 1 (espèce nitrofuge) à 10 (espèce nitrophile), la valeur nulle étant attribuée aux espèces indifférentes au niveau de fertilité azotée du sol
L'indice stationnel (moyenne des indices spécifiques du relevé, pondérée ou non par les dominances) varie généralement entre 2 et 8
Il  s'agit d'un indice que l'on peut associer au niveau de fertilité (de trophie) général de la prairie
Source :  Ellenberg, H., Weber, H.E., Düll, R., Wirth, V., Werner, W., Paulissen, D., 1992 - Zeigerwerte von Pflanzen in Mitteleuropa. 2ten Auffl. Scripta Geobot., 18 : 258 p.        

Retour index

B

B%

Contribution à la production d' une espèce au sein de la végétation. La détermination du B% se fait à partir d'une estimation visuelle du volume relatif de chaque espèce au sein d'un échantillon. Cet échantillon est soit prélevé (méthode des poignées, destructive) soit observé dans un quadrat (méthode non destructive).

Retour index

Braun-Blanquet (coefficients d'abondance-dominance)

Échelle des coefficients d’abondance-dominance de Braun-Blanquet
5 : recouvrement > 75% de la surface de référence, abondance quelconque                        (Rm = 87,5%)  
4 : recouvrement entre 50 et 75% de la surface de référence, abondance quelconque          (Rm = 62,5%)
3 : recouvrement entre 25% et 50% de la surface de référence, abondance quelconque       (Rm = 37,5%)
2 : recouvrement entre 5 et 25% de la surface de référence, individus très abondants           (Rm = 15,0%)
1 : recouvrement < 5% de la surface de référence, éléments assez abondants                      (Rm = 2,5%b)
+ : Peu d’individus, avec très faible recouvrement (inférieur à 1%)                                       (Rm = 0,1%)
r : Rare

.Rm Recouvrement moyen

Retour index

C

Catégorie fourragère

Classement des espèces selon leur valeur fourragère et leur catégorie botanique  
Catégorie botanique Valeur fourragère Catégorie fourragère
Graminée 9 ou 10 Très bonne graminée
Graminée 7 ou 8 Bonne graminée
Graminée 5 ou 6 Assez bonne graminée
Graminée 1, 2, 3 ou 4 Graminée médiocre
Graminée 0 Graminée non fourragère
Légumineuse 8, 9 ou 10 Très bonne légumineuse
Légumineuse 7 Bonne légumineuse
Légumineuse 3, 4, 5 ou 6 Assez bonne légumineuse
Légumineuse 1 ou 2 Légumineuse médiocre
Légumineuse 0 Légumineuse non fourragère
Diverse 3 ou 4 Diverse fourragère
Diverse 1 ou 2 Diverse médiocre
Diverse 0 Diverse non fourragère

Retour index

Climat

e-FLORA-sys proposera prochainement une base de données sur les climats qui permettra de décrire le climat d’une station floristique, ou d’accéder à un ensemble de climats génériques (classification de Köppen-Geiger). Ces climats pourront soit correspondre au climat d’une année particulière, soit à des climats moyens (exemple : moyennes trentenaires fournies par Météo-France). Les informations sur les climats seront utilisées pour pouvoir relier la végétation des prairies (relevé floristique) aux caractéristiques du climat, mais aussi pour prédire grâce à FLORA-Predict une composition floristique (relevé « virtuel »).

Retour index

Code MNHN

Code taxonomique de la Base de Données Nomenclaturale de la Flore de France, attribué à l'espèce Benoit BOCK, et accepté par le Museum National d'Histoire Naturelle comme  "Référentiel Taxonomique de la flore vasculaire de la France métropolitaine"

Retour index

Code relevé

Code affecté à chaque relevé floristique dans e-FLORA-sys. La syntaxe de ce code est libre, mais il est recommandé de rappeler dans ce code l'étude ou le secteur d'étude et l'année du relevé.

Retour index

Code station

Code affecté à chaque station dans e-FLORA-sys. La syntaxe de ce code est libre, mais il est recommandé de rappeler dans ce code la parcelle ainsi que la partie de la parcelle concernée par la station.

Retour index

Continentalité (indice de)

Indice de continentalité du sol selon Ellenberg.
L'indice spécifique varie de 1 (espèce de climat atlantique) à 10 (espèce de climat continental), la valeur nulle étant attribuée aux espèces indifférentes au type de climat
L'indice stationnel (moyenne des indices spécifiques du relevé, pondérée ou non par les dominances) varie généralement entre ? et ?
Source :  Ellenberg, H., Weber, H.E., Düll, R., Wirth, V., Werner, W., Paulissen, D., 1992 - Zeigerwerte von Pflanzen in Mitteleuropa. 2ten Auffl. Scripta Geobot., 18 : 258 p

Retour index

Contrastes hydriques (indice d'adaptation)

Aptitude de l'espèce à supporter un fort contraste hydrique du sol selon Ellenberg
Le contraste hydrique correspond généralement marqué par des périodes de sécheresse estivales et des périodes de forte humidité du sol (printemps, automne et hiver)
L'indice prend deux valeurs : oui (espèce adaptée aux contrastes hydriques) ou non (espèce non adaptée aux contrastes hydriques)
 Source :  Ellenberg, H., Weber, H.E., Düll, R., Wirth, V., Werner, W., Paulissen, D., 1992 - Zeigerwerte von Pflanzen in Mitteleuropa. 2ten Auffl. Scripta Geobot., 18 : 258 p Retour index

Coupes fréquentes (indice de résistance)

Aptitude de l'espèce à supporter un fort contraste hydrique du sol selon Ellenberg
Le contraste hydrique correspond généralement marqué par des périodes de sécheresse estivales et des périodes de forte humidité du sol (printemps, automne et hiver)
L'indice prend deux valeurs : oui (espèce adaptée aux contrastes hydriques) ou non (espèce non adaptée aux contrastes hydriques)
 Source :  Ellenberg, H., Weber, H.E., Düll, R., Wirth, V., Werner, W., Paulissen, D., 1992 - Zeigerwerte von Pflanzen in Mitteleuropa. 2ten Auffl. Scripta Geobot., 18 : 258 p

Retour index

Cs%

Contribution spécifique selon la méthode des points sensu DAGET et POISSONET. Le Cs% peut être calculé de deux manières :
CSP : Contribution Spécifique Présence, rapport exprimé en pourcentage, entre la fréquence spécifique d'une espèce donnée et la somme des fréquences spécifiques de toutes les espèces. Elle tend vers le recouvrement relatif de l'espèce quand l'unité observée tend vers le point, et traduit la participation de l'espèce au recouvrement de la surface du sol.
CSC : Contribution Spécifique Contact, rapport exprimé en pourcentage, entre le nombre de contacts d'une espèce donnée et la somme des contacts de toutes les espèces, chaque espèce étant comptée autant de fois qu'elle touche l'aiguille. Cette contribution traduit la participation de l'espèce au biovolume aérien (et se rapproche en ce sens du B%)
Source : F.GILLET (2000). Méthodes d'étude de la végétation. 70p. Ed Université de Neufchâtel

 Retour index

CSR (stratégie)

Une stratégie végétale est une classification des espèces basée sur les traits qui sont fortement liés aux pressions de sélection de l’environnement. Selon Grime, il existe deux gradients environnementaux (=forces sélectives) majeures : le stress et les perturbations. A ces gradients s’ajoute un facteur intrinsèque à la végétation : la compétition. Un stress est tout facteur de l’environnement qui limite la production de biomasse. Une perturbation est tout facteur de l’environnement (incluant les autres organismes) qui cause la destruction de la biomasse végétale déjà produite. La classification CSR place les espèces en fonction de ces 3 forces sélectives, en Compétitrices, tolérantes au Stress et Rudérales (résistantes aux perturbations). Ces trois catégories peuvent être représentées comme les 3 sommets d'un triangle, et chaque espèce comme un point au sein de ce triangle, en fonction de ses caractéristiques.

Retour index

Cycle de vie

Cycle de vie de l'espèce : annuelle, bisannuelle, pérenne ou vivace

Retour index

D

Diaspores

Une diaspore est tout élement permettant d'accomplir la dissémination d'une espèce végétale (par reproduction ou par multiplication asexuée).

Retour index

Dispersion

La base des espèces précise le mode et les dates de dispersion des diaspores des espèces. Le mode de dispersion peut être anémochore (par le vent), zoochore (par les animaux au sens large), épizoochore (par l'extérieur des animaux, ex : accroché sur le pelage), myrmezoochore (par les fourmis), barochore (par gravité), hydrochore (par l'eau), anthropochore (par l'activité humaine comme la récolte et le transport du foin), autochore (par action mécanique de la plante)

Retour index

E

Ellenberg

Ellenberg (1919-1997) : Ecologue allemand auteur de nombreux ouvrages sur la végétation prairiale, qui a proposé des indices phytoécologiques (humidité du sol, température, continentalité,  lumière, fertilité azotée, ..) pour plus de 2000 espèces de la végétation prairiale d'Europe centrale

Ellenberg, H., 1974 - Zeigerwerte der Gefässpflanzen Mitteleuropas. Scripta Geobot., 9 : 97 p.
Ellenberg, H., 1979 - Zeigerwerte der Gefässpflanzen Mitteleuropas. 2ten Auffl. . Scripta Geobot., 9 : 122 p.
Ellenberg, H., Weber, H.E., Düll, R., Wirth, V., Werner, W., Paulissen, D. 1991 - Zeigerwerte von Pflanzen in Mitteleuropa. Scripta Geobot., 18 : 248p.
Ellenberg, H., Weber, H.E., Düll, R., Wirth, V., Werner, W., Paulissen, D. 1992 - Zeigerwerte von Pflanzen in Mitteleuropa. 2ten Auffl. Scripta Geobot., 18 : 258 p.
Hill, M. O., J. O. Mountford, D. B. Roy, R. G. H. Bunce. 1999. Ellenberg's Indicator Values for British Plants. Technical Annex. Institute of Terrestrial Ecology, Huntingdon, UK.

Retour index

Espèce vulnérante

Espèce refusée par les animaux, soit en raison de sa toxicité, soit en raison des blessures qu'elle est susceptible d'engendrer

Retour index

Etat calcique (Indice d')

Indice d'état calcique du sol selon Ellenberg.
L'indice spécifique varie de 1 (espèce acidophile) à 10 (espèce basidophile), la valeur nulle étant attribuée aux espèces indifférentes au pH du sol
L'indice stationnel (moyenne des indices spécifiques du relevé, pondérée ou non par les dominances) varie généralement entre 2,5 et 8
Source :  Ellenberg, H., Weber, H.E., Düll, R., Wirth, V., Werner, W., Paulissen, D., 1992 - Zeigerwerte von Pflanzen in Mitteleuropa. 2ten Auffl. Scripta Geobot., 18 : 258 p


Retour index

F

Fertilité du sol (indices de)

Voir indice de fertilité azotée, indice de fertilité phosphorique, indice de fertilité potassique

Retour index

Feu (indice de résistance)

Indice de résistance de la végétation au feu selon Ellenberg.
L'indice spécifique varie de 1 (espèce peu résistante) à 10 (espèce très résistante)
Source :  Ellenberg, H., Weber, H.E., Düll, R., Wirth, V., Werner, W., Paulissen, D., 1992 - Zeigerwerte von Pflanzen in Mitteleuropa. 2ten Auffl. Scripta Geobot., 18 : 258 p

Retour index

FLORA-Predict

Modèle de prévision de la composition floristique d’une prairie élaboré par le Laboratoire Agronomie et Environnement Nancy-Colmar (LAE). La probabilité de présence dans une station floristique des espèces actuellement dans la base (près de 3000 espèces) est calculée à partir des caractéristiques de la station (sol, climat, pratiques) et des caractéristiques des espèces (traits de vie, indices écologiques). FLORA-Predict est un modèle mécaniste basé sur des systèmes experts associés à de la logique floue. Il génère des relevés « virtuels » qui peuvent ensuite être traités comme les relevés « réels » par e-FLORA-sys, notamment pour le calcul de la valeur fourragère et écologique de ces relevés.

Retour index

Fréquence : F%, Fs%

La fréquence d'une espèce est la probabilité de trouver un individu au sein d'une surface donnée. On distingue la fréquence absolue d'une espèce (nombre de parcelles où l'espèce est présente rapporté au nombre total de parcelle) de sa fréquence relative (fréquence absolue d'une espèce rapporté à la somme des fréquences absolues de toutes les espèces).
Source : F.GILLET (2000). Méthodes d'étude de la végétation. 70p. Ed Université de Neufchâtel

F% : Dans la méthode B%-F% proposée par e-FLORA-sys, F% désigne pour une espèce la proportion de poignées ou de quadrats où l'espèce a été trouvée, par rapport au nombre de poignées ou de quadrats total de la station. Il s'agit donc d'une déclinaison de la notion de fréquence absolue où les parcelles sont remplacées par les poignées ou quadrats au sein d'une station.

Fs% : Dans la méthode Cs%-FS% ou méthode des points sensu DAGET&POISSONNET, la fréquence spécifique centésimale (Fs) est le rapport, exprimé en pourcentage, entre le nombre de présence (présence= observation de l'espèce sous un point) et le nombre total de points observés. elle tend vers le recouvrement de l'espèce quand la surface tend vers un point et que le nombre de surfaces observées est grand. Source : F.GILLET (2000). Méthodes d'étude de la végétation. 70p. Ed Université de Neufchâtel

Retour index

G

H

Humidité du sol (indice de)

Indice d'état hydrique du sol selon Ellenberg.
L'indice spécifique varie de 1 (espèce xérophile) à 10 (espèce hygrophile), la valeur nulle étant attribuée aux espèces indifférentes à l'état hydrique du sol
L'indice stationnel (moyenne des indices spécifiques du relevé, pondérée ou non par les dominances) varie généralement entre 4 et 8,5
Source :  Ellenberg, H., Weber, H.E., Düll, R., Wirth, V., Werner, W., Paulissen, D., 1992 - Zeigerwerte von Pflanzen in Mitteleuropa. 2ten Auffl. Scripta Geobot., 18 : 258 p

Retour index

I

Indication phytosociologique


Retour index

Indices écologiques

 e-FLORA-sys utilise des indices écologiques (ou phytoécologiques) attribués à chaque espèce (indice spécifique) pour calculer des indices stationnels (moyenne des indices spécifiques des espèces du relevé floristique.
 Les indices spécifiques sont issus de la littérature (indices d'Ellenberg) ou d'indices mis au point par le Laboratoire Agronomie et Environnement (LAE). Ces indices vont de 0 à 10, la valeur nulle indiquant que l'espèce est indifférence au facteur concerné, et les valeurs de 1 à10 sont attribuées selon la préférence vis-à-vis du facteur. Par exemple, l'indice d'humidité du sol prend la valeur 1 ou 2 pour les espèces caractéristiques des milieux secs (espèces xérophiles), et 9 ou 10 pour les espèces caractéristiques des milieux humides (espèces hygrophyltes)   

Deux modes de calcul  de l'indice stationnel sont proposés :
    Indice calculé sur présence = moyenne des indices spécifiques des espèces présentes, à l'exclusion des espèces indifférentes au facteur (indice spécifique nul) ou dont l'indice est inconnu


                Y= indice stationnel calculé sur présence
                Xk = valeur de l'indice spécifique pour chaque espèce k
                n = nombre d’espèces du relevé dont Xk est connu et non nul (n ≤ nombre d'espèces total du relevé)

    Indice calculé sur dominance = moyenne pondérée par la dominance des espèces des indices spécifiques des espèces présentes moyenne , à l'exclusion des espèces indifférentes au facteur (indice spécifique nul) ou dont l'indice est inconnu

    
            Y= indice stationnel calculé sur dominance
            Xk = valeur de l'indice spécifique pour chaque espèce k
            n = nombre d’espèces du relevé dont Xk est connu et non nul (n ≤ nombre d'espèces total du relevé
            Yk=  B% ou Cs% ou R%
 
Liste des indices calculés par e-FLORA-sys
    Indice d'humidité du sol d'Ellenberg
    Indice de lumière d'Ellenberg
    Indice de température d'Ellenberg
    Indice de continentalité d'Ellenberg 
    Indice d'état calcique d'Ellenberg
    Indice de salinité d'Ellenberg
    Indice de fertilité azotée d'Ellenberg
    Indice de fertilité phoshorique
    Indice de fertilité potassique
    Indice de résistance au piétinement animal d'Ellenberg
    Indice de résistance aux coupes fréquentes d'Ellenberg
    +   
    Nombre et contribution des espèces adaptées aux contrastes hydriques (Ellenberg)
    Nombre et contribution des espèces résistantes à la submersion (Ellenberg)

 Source :  Ellenberg, H., Weber, H.E., Düll, R., Wirth, V., Werner, W., Paulissen, D., 1992 - Zeigerwerte von Pflanzen in Mitteleuropa. 2ten Auffl. Scripta Geobot., 18 : 258 p

Retour index

J

K

L

LAE

Laboratoire Agronomie et Environnement : Unité Mixte de Recherche entre Nancy-Université (INPL-ENSAIA) et l'INRA, qui a créé e-FLORA-sys. Voir le site du laboratoire : cliquer ici.

Retour index

Liste rouge

Statut de protection de l'espèce : rare, en danger, vulnérable
Source : Tome 1 du Livre rouge de la flore menacée de France 1995 : cliquer ici

Retour index

Lumière (indice de)

Indice de lumière selon Ellenberg.
L'indice spécifique varie de 1 (espèce ombrophile) à 10 (espèce de lumière), la valeur nulle étant attribuée aux espèces indifférentes à la lumière
L'indice stationnel (moyenne des indices spécifiques du relevé, pondérée ou non par les dominances) varie généralement entre ? et ?
Source :  Ellenberg, H., Weber, H.E., Düll, R., Wirth, V., Werner, W., Paulissen, D., 1992 - Zeigerwerte von Pflanzen in Mitteleuropa. 2ten Auffl. Scripta Geobot., 18 : 258 p

Retour index

M

Matière organique du sol (indice de)

Indice de lumière selon Ellenberg.
L'indice spécifique varie de 1 (espèce ombrophile) à 10 (espèce de lumière), la valeur nulle étant attribuée aux espèces indifférentes à la lumière
L'indice stationnel (moyenne des indices spécifiques du relevé, pondérée ou non par les dominances) varie généralement entre ? et ?
Source :  Ellenberg, H., Weber, H.E., Düll, R., Wirth, V., Werner, W., Paulissen, D., 1992 - Zeigerwerte von Pflanzen in Mitteleuropa. 2ten Auffl. Scripta Geobot., 18 : 258 p

Retour index

Méthodes de relevé

e-FLORA-sys propose plusieurs méthodes d'étude de la végétation (ou de relevé floristique)
1) Méthode "B%-F%" : méthode adaptée aux relevés réalisés sur des surfaces ou avec des poignées. Le B% correspond à la contribution à la production de l'espèce, c'est à dire à l'estimation de sa proportion dans ma biomasse végétale. Le F% est la fréquence de l'espèce, calculée comme le nombre de surfaces ou de poignées où l'espèce est présente, rapporté au nombre total de surfaces ou de poignées du relevé floristique.
2) Méthode "Cs%-Fs%" : méthode adaptée aux relevés réalisés sur des points. Le Cs% correspond à la contribution spécifique et le Fs% est la fréquence spécifique
3) Méthode "Abondance dominance" : cliquer ici
4) Méthode "R%" : méthodes où l'on obtient un recouvrement (R%), soit directement, soit estimé à partir des coefficients d'abondance-dominance
e-FLORA-sys tient compte des différentes méthodes pour le calcul des indices écologiques et agrionomiques
Sur demande auprès des auteurs d'e-FLORA-sys, des méthodes peuvent être ajoutées.

Retour index

N


O


P

Parties aériennes

pH (indice de)

voir Indice d'état calcique

Retour index

Phosphore (Indice de fertilité)

Indice de fertilité phosphorique du sol 
L'indice spécifique varie de 1 (espèce de milieu pauvre en phosphore) à 10 (espèce de milieu riche en phosphore), la valeur nulle étant attribuée aux espèces indifférentes à la fertilité P du sol
L'indice stationnel (moyenne des indices spécifiques du relevé, pondérée ou non par les dominances) varie généralement entre ? et ?
Source : LAE

Retour index

Phytosociologie

Voir définition fournie par le site Telabotanica : cliquer ici

Retour index

Piétinement animal (indice de résistance)

Indice de résistance au piétinement animal selon Ellenberg.
L'indice spécifique varie de 1 (espèce peu résistante au piétinement animal) à 10 (espèce très résistante au piétinement animal), la valeur nulle étant attribuée aux espèces indifférentes au piètinement animal
L'indice stationnel (moyenne des indices spécifiques du relevé, pondérée ou non par les dominances) varie généralement entre 4 et 8,5
Source :  Ellenberg, H., Weber, H.E., Düll, R., Wirth, V., Werner, W., Paulissen, D., 1992 - Zeigerwerte von Pflanzen in Mitteleuropa. 2ten Auffl. Scripta Geobot., 18 : 258 pSource :  Ellenberg, H., Weber, H.E., Düll, R., Wirth, V., Werner, W., Paulissen, D., 1992 - Zeigerwerte von Pflanzen in Mitteleuropa. 2ten Auffl. Scripta Geobot., 18 : 258 p

Retour index

Potassium (Indice de fertilité)

Indice de fertilité potassique du sol (en cours de renseignement dans la base de e-FLORA-sys)
L'indice spécifique varie de 1 (espèce de milieu pauvre en potassium) à 10 (espèce de milieu riche en potassium ), la valeur nulle étant attribuée aux espèces indifférentes à la fertilité K du sol
L'indice stationnel (moyenne des indices spécifiques du relevé, pondérée ou non par les dominances) varie généralement entre ? et ?
Source : LAE

Retour index

Pratiques agricoles

Actions récentes ou anciennes réalisées par l'agriculteur sur le prairie : modalités et intensité du mode d'utilisation (pâture, fauche, mixte), de la fertilisation minérale et organique, et des interventions diverses (fauche des refus, travail superficiel du sol, étaupinage, désherbage, ...). Les pratiques agricoles sont associées à une station, et sont datées afin de prendre en compte l'évolution de ces pratiques

Retour index

Protection régionale

Espèce sous statut de protection française niveau régionale
Source : Telabotanica

Retour index

Q


R

R%

Recouvrement de l'espèce. Le recouvrement exprime l'occupation des organes aériens vivants en projection verticale sur le sol
Source : F.GILLET (2000). Méthodes d'étude de la végétation. 70p. Ed Université de Neufchâtel Le recouvrement moyen peut-être estimé à partir des coefficients d'abondance-dominance

Retour index

Raunkier (type de )

On distingue, selon la classification de RAUNKIER , les types suivants qui sont définis d’après la morphologie du végétal : -         les phanérophytes ( phaneros = visible) : ce sont des plantes ligneuses ou nanophanérophytes, herbacées dans les régions tropicales humides, succulentes ou grimpantes dont les bourgeons pérennants sont situés à plus de 25 cm au dessus du sol.
-         Les chaméphytes ( chamai = à terre) : ce sont des ligneux dressés, des ligneux à rameaux couchés ou des herbacés rampants dont les bourgeons pérennants sont situés à moins de 25 cm au dessus du sol. Les xérochaméphytes ont un port en boule ou en coussinet avec des aiguillons.
-         Les hémicryptophytes ( cryptos = caché) : ce sont des plantes herbacées dont les bourgeons sont au ras du sol. L’appareil aérien disparaît lors de la mauvaise saison.
-         Les cryptophytes : ce sont des végétaux dont les organes aériens sont fugaces mais dont les parties pérennes sont protégées sous terre ( géophytes), dans la vase humide                   ( hélophytes) ou dans l’eau ( hydrophytes).
-         Les thérophytes ( théros = été) : ces plantes subsistent à la mauvaise saison sous forme de graines uniquement
-         Les épiphytes : se développent sur des supports vivants.  
Source : Channay, Site internet Académie Orléans-Tours

Retour index

Relevé floristique

Pour e-Flora-sys, le relevé floristique désigne la liste des espèces végétales d'une station prairiale, l'évaluation de leur importance (fréquence, dominance, recouvrement, ...). Un relevé (acte d'analyse de la végétation) est rattaché à une station (lieu où cette analyse est réalisée). Plusieurs relevés peuvent être réalisés sur une même station à des dates différentes.

Retour index

S

Salinité (indice de)

Indice de salinité du sol selon Ellenberg.
L'indice spécifique varie de 1 (espèce non halophile) à 10 (espèce halophile), la valeur nulle étant attribuée aux espèces indifférentes à la teneur en sel du sol
L'indice stationnel (moyenne des indices spécifiques du relevé, pondérée ou non par les dominances) varie généralement entre ? et ?
Source :  Ellenberg, H., Weber, H.E., Düll, R., Wirth, V., Werner, W., Paulissen, D., 1992 - Zeigerwerte von Pflanzen in Mitteleuropa. 2ten Auffl. Scripta Geobot., 18 : 258 p

Retour index

Sol

Pour e-Flora-sys, la notion de sol correpond à la description des caractéristiques physiques, chimiques et biologiques des horizons d'un sol. Ce sol peut être soit un sol particulier, décrit sur une station, ou un sol générique, issu de la typologie des sols européens (Référentiel pédologique Baize et Girard 2008).

Retour index

Station

Surface homogène sur le plan des conditions de milieu, des pratiques et du type de végétation (faciès). Une parcelle agricole peut comporter une ou plusieurs stations. Un relevé floristique doit être réalisé au sein d'une station (ou d'un faciès). e-FLORA-sys associe à une station : un ou plusieurs relevés floristiques, un sol, un climat et des pratiques agricoles. Chaque station est associée à une zone géographique, et à la parcelle dans laquelle elle se trouve.

Retour index

Stratégie CSR

Voir CSR (Stratégie)

Retour index
        

Submersion (indice de résistance)

Aptitude de l'espèce à supporter uns longue période de submersion selon Ellenberg
L'indice prend deux valeurs : oui (espèce adaptée à la submersion) ou non (espèce non adaptée à la submersion)
 Source :  Ellenberg, H., Weber, H.E., Düll, R., Wirth, V., Werner, W., Paulissen, D., 1992 - Zeigerwerte von Pflanzen in Mitteleuropa. 2ten Auffl. Scripta Geobot., 18 : 258 p

Retour index

Système racinaire

Type de système racinaire : système fasciculé, bulbe, tubercule, rhizome, stolons, sucoirs, drageon
          Autres caractéritiques : présence d'un organe de réserve, ramification, diamètre et longueur 

Retour index

T

Température (indice de)

Indice de température moyenne annuelle du sol selon Ellenberg.
L'indice spécifique varie de 1 (espèce thermophile) à 10 (espèce de climat chaud), la valeur nulle étant attribuée aux espèces indifférentes au type de climat
L'indice stationnel (moyenne des indices spécifiques du relevé, pondérée ou non par les dominances) varie généralement entre ? et ?
Source :  Ellenberg, H., Weber, H.E., Düll, R., Wirth, V., Werner, W., Paulissen, D., 1992 - Zeigerwerte von Pflanzen in Mitteleuropa. 2ten Auffl. Scripta Geobot., 18 : 258 p

Retour index

U


V

Valeur fourragère

Valeur d'une espèce sur le plan de ses qualités fourragères. Cet indice varie de 0 (espèce non consommée par les animaux) à 10 (excellent espèce fourragère). Elle est principalement basée sur la productivité (c'est à dire le potentiel de production de biomasse de l'espèce), mais peut être minorée en raison de défauts de l'espèce (ex : manque d'appétence malgré une forte productivité). La valeur pastorale d'une prairie est caculée à partir de la valeur fourragère des espèces qui composent le relevé floristique. Source: les valeurs de valeur fourragère de la base d'e-FLORA-sys sont issues d'une synthèse d'informations bibliographiques et de l'expertise du LAE

Retour index

Valeur pastorale

Valeur de la prairie sur le plan fourrager, caculée à partir de la moyenne des valeurs fourragères des espèces qui composent le relevé floristique, moyenne pondérée par la dominance des espèces (B%, Cs% ou R%). Cette valeur traduit la production potentielle d'une prairie, mais n'est pas directement reliée à sa production réelle. En effet, la valeur pastorale évalue la "qualité moyenne" de la flore sur le plan fourrager, et la capacité des espèces à produire de la biomasse. La production réelle d'une prairie est infleuncée par cette qualité moyenne, mais aussi par des facteurs tels que le climat.

Retour index

Vulnérance

Une espèce vulnérante est une espèce refusée par les animaux en raison soit de sa toxicité, soit de sa morphologie (ex : épines)
Source :  Ellenberg, H., Weber, H.E., Düll, R., Wirth, V., Werner, W., Paulissen, D., 1992 - Zeigerwerte von Pflanzen in Mitteleuropa. 2ten Auffl. Scripta Geobot., 18 : 258 p

Retour index

W


X


Y


Z

Zone géographique

Commune, département, région, pays dans lequel se trouve une station.

Retour index